事件の噂と並行して検索されることが多いのが「いじめ」に関する憶測です。インターネット上の掲示板では、特定学年での不和やトラブルを針小棒大に煽る書き込みが散見される時期がありました。
品川区教育委員会の基本方針に基づき、荏原平塚学園では年数回の定期いじめアンケートやスクールカウンセラーによる個別面談が徹底されています。教育委員会が公表している学校評価報告書等を確認しても、組織的な隠蔽や放置による重大事態の認定事例はなく、発生した人間関係の摩擦に対しては早期指導と保護者面談による解決が図られています。
教育関係者によると、小中一貫校では1年生から9年生（中学3年生）まで幅広い年齢層が同一校舎で過ごすため、上級生の言動が下級生の保護者から見て過度に威圧的に映り、それが「いじめの噂」として外部に伝わってしまう心理的ギャップも影響していると分析されています。
