お釣りに関するルールは、ビール共通券を使う上で最も注意すべきポイントです。全国酒販協同組合連合会(全酒協)のガイドラインでは「お釣りは出さないよう努める」とされていますが、実際のコンビニ店頭では対応が分かれています。
ファミリーマートやローソンの一部店舗では、システム上お釣りが出る設定になっているケースが見られます。一方で、セブン-イレブンなどでは「お釣りは出ないため、額面以上の買い物をして差額を電子マネーや現金で支払う」ことを推奨されるのが一般的です。損をしないためには、額面(例えば缶ビール2缶券なら488円や504円など)を少し超える金額の買い物をするのが賢い選択と言えます。