両チェーンを比較する上で、最も本質的な違いが出るのが「麺の製法」と「出汁の根幹」だ。
丸亀製麺の最大の特徴は、全店舗に製麺機を配置し、小麦粉と塩と水だけを使って店内で小麦から麺を打ち、茹で上げている点にある。出来立て・茹で立ての「生きている麺」を提供することへの執着が、独特の強いコシとモチモチとした食感を生み出している。出汁も店舗ごとに毎日のように昆布や複数の削り節から削り出し、風味豊かなアツアツのツユを提供する。
対するはなまるうどんは、本場・香川県高松市発祥の誇りを胸に、自社工場を中心とした高品質な製麺管理と独自の綾織り製法を徹底している。一定のクオリティを保ったツルツルとした喉越しの良い麺が特徴だ。出汁には讃岐うどんの伝統である「いりこ（煮干し）」をメインに使用。昆布や風味豊かな醤油をベースにした優しく深みのある澄んだツユは、毎日飲んでも飽きがこないと根強いファンを持つ。
