杜の湯きらの里の評判を分ける決定的な要素が「客室選び」です。同宿には性格の異なる4つの宿泊棟が存在し、選んだ部屋のタイプによって滞在の快適度が180度変わります。
最も贅沢な滞在を叶えるのが、数寄屋造りの客室露天風呂を備えた「離れ 竹嶺（ちくれい）」です。木立に囲まれた静寂な平屋・メゾネットタイプで、大人のプライベートな時間を過ごすのに最適です。源泉の湯を独り占めできる専用露天風呂が付いているため、後述する貸切風呂の混雑に左右されることなく、至福の湯浴みを満喫できます。
一方、敷地の中央付近に位置し、利便性とリゾート感を高いバランスで両立させているのが「別邸 山の音（やまのね）」です。全室に檜の半露天風呂やバルコニーが設えられ、里山の風景を見下ろす開放感があります。本館や大浴場へのアクセスも比較的良好で、カップルから家族連れまで最も失敗が少ない選択肢として支持されています。
より手軽に里山風情を味わうなら、古民家の温かみを残した「うみべの杜 うみ」「やすらぎの里 まゆ」などの客室棟もありますが、こちらは階段の昇降が必要なケースやシャワーブースのみの客室も存在します。移動のしやすさや客室風呂の有無を事前にしっかり確認することが、宿泊後の後悔を防ぐ絶対条件です。
