人の瞳のカラーを決定づけているのは、黒目の中心を取り囲む「虹彩」に存在するメラニン色素の量とバランスだ。メラニンには黒〜褐色系のユーメラニンと、黄〜赤色系のフェオメラニンがあり、この2つの配合比率と絶対量によって瞳の色が決まる。
東アジア人の多くはユーメラニンが豊富でダークブラウンや黒に近い瞳を持つのが一般的だ。しかし、遺伝的な個体差や体質によってメラニン生成が控えめな人も一定数存在する。地域的なルーツや家系の体質的特徴によって、生まれつき色素が控えめで軽やかな茶色や琥珀色を帯びた瞳を持つ日本人が存在する理由はここにある。