アゴダの最大の武器は、何と言っても他の旅行サイト（OTA）を寄せ付けない圧倒的な低価格だ。「同価格保証（ベストプライス保証）」や期間限定のタイムセール、アプリ限定クーポンが重なると、高級ホテルが半額近い価格で売り出されることも珍しくない。
しかし、この「安さ」こそが不信感の引き金になっている。なぜアゴダだけがこれほど安く提供できるのか。その理由は、世界各地の卸業者（ホールセラー）から客室在庫をバルク（一括）買い取りする特殊な仕入れルートにある。ホテルが直接出していない格安在庫が巡り巡ってアゴダ上で販売されるため、価格破壊が起きるのだ。だが、この複雑な仲介構造こそが、トラブルの根源となっている。
