預け入れだけでなく、「硬貨でのお金の引き出し」や「紙幣から小銭への両替」を行う際にも手数料が発生します。
窓口で預金の払い戻しを受ける際、受け取る金種の枚数を指定する場合には「ゆうちょ銀行金種指定手数料」が適用されます。指定した硬貨や紙幣の合計枚数が一定枚数（無料枠）を超える場合、枚数に応じた追加手数料が必要となります。
また、ATMから預金を引き出す際に硬貨が含まれる場合（例：9,500円を引き出して500円玉を受け取るなど）も、ATM硬貨預払料金（1回あたり110円）が引き出し手数料とは別枠で加算されます。「端数を引き出すために110円取られる」という事態を避けるため、ATMからの出金は千円単位にまとめるのが賢明です。
