宇佐神宮の主祭神は、第15代天皇である応神天皇（誉田別命）である。八幡神の化身として祀られる応神天皇は、文武両道の神であり、開運や勝利の象徴として武家社会からも絶大な信仰を集めてきた。
しかし、境内の構造や祀られ方には一般的な神社とは異なる異例の配置が見られる。本殿では一の御殿に応神天皇、二の御殿に比売大神、三の御殿に神功皇后が祀られているが、最も重要な中央の二の御殿に謎多き「比売大神」が鎮座している点など、古くから古代史研究者の間で様々な憶測を呼んできた。神道のルーツと仏教の深い情念が交差し、応神天皇の強大な神威が重なることで、他にはない唯一無二の神秘性と、どこか立ち入りがたい荘厳な恐怖感が生まれているのだ。
