第二次世界大戦の終結に伴う旧日本軍の解体により、旭日旗の使用は一時途絶えました。しかし、1954年（昭和29年）の自衛隊発足に伴い、自衛隊法施行令によって公式に再採用されています。
現在、海上自衛隊は旧海軍と同じ「十六条旭日旗」を「自衛艦旗」として掲示し、陸上自衛隊は周囲に黄色の縁取りを施した「八条旭日旗」を「自衛隊旗」として使用しています。
国際法（国連海洋法条約など）において、公海上を航行する軍艦は所属国を示す外部標識（軍艦旗）の掲揚が義務付けられています。海上自衛隊の自衛艦旗は、世界各国の海軍から「日本国の正規の防衛組織を示す公の旗」として完全に承認されており、外交プロトコル上も不可欠な識別標として機能しています。
外務省の公式見解でも、「旭日旗の意匠は日章旗と同様、太陽をかたどっており、日本国内で広く親しまれている。自衛艦旗・自衛隊旗としての掲揚は国際法上も正当な行為である」と明記され、多言語で世界に向けた発信が続けられています。
