杏林大学を検討する上で押さえておきたいのが、約1.5kmほど東に位置する三鷹キャンパスとの機能の違いです。三鷹キャンパス（三鷹市新川）は、医学部および医学部付属病院が置かれた高度医療・臨床研究の拠点となっています。
三鷹キャンパスが白衣の医療従事者や実習生が行き交う専門的な医療タウンの趣を持つのに対し、井の頭キャンパスは広大な敷地に芝生やオープンスペースが広がるリベラルアーツ・アカデミック拠点です。保健学部の学生は、学年や履修科目に応じて両キャンパスの施設を効率的に活用します。
文系学部と医療系学部の学生が同じキャンパスで日常的に交わることで、他分野への理解や多角的な視野が育まれます。この「文医融合」の教育体制こそが、単科大学や郊外型キャンパスにはない独自の強みです。
