奥宮への参拝を計画する際、最も慎重に確認しなければならないのが冬季閉鎖のタイミングです。奥宮が位置する富士山二合目は豪雪地帯であり、アクセス経路となる山梨県道701号（富士上吉田線）および「滝沢林道」は、降雪と路面凍結のため例年11月下旬から翌年4月下旬または5月上旬頃まで全面通行止めとなります。
閉鎖期間中は林道入口に頑丈なゲートが施され、車両の進入は完全に遮断されます。「せっかく遠方から訪れたのにゲートが閉ざされていて参拝できなかった」という悲劇を防ぐためにも、初冬から春先にかけての訪問は本宮のみに留めるか、自治体や観光協会の道路開通情報を事前に確認することが必須です。
車アクセスの場合、中央自動車道の「河口湖IC」または東富士五湖道路の「富士吉田IC」を起点とし、まずは新屋山神社本宮へ向かいます（ICから約10分）。本宮参拝後、国道138号から「中の茶屋」方面を経由して滝沢林道へと入っていきます。本宮から奥宮までの所要時間は通常時で約25分から30分程度です。
ただし、滝沢林道の走行には細心の集中力が求められます。道幅は極めて狭く、対向車とすれ違うための待避所（すれ違いポイント）が点在しているものの、見通しの悪い急カーブが連続します。ガードレールが設置されていない箇所や、路面に落石・枯れ枝が散乱しているエリアも少なくありません。大型のミニバンや車高の低いスポーツカーでのアクセスは難易度が高く、運転に不慣れな方はコンパクトカーや軽自動車を選択するのが賢明です。また、奥宮周辺の駐車スペースは限られているため、土日祝日の混雑時間帯（11:00〜14:00）を避けた早朝参拝が推奨されます。
