新岡山港と小豆島・土庄港を結ぶ航路は、両備グループの両備フェリーが運航を担当しています。通常ダイヤでは1日13往復が設定されており、早朝6時台の始発便から夜18時台・19時台の最終便まで、おおむね1時間から1時間半に1本のペースで出航しています。新岡山港から土庄港までの所要時間は片道約70分です。
旅客運賃は大人片道1,200円（往復割引適用で2,280円）、小人（小学生）片道600円（往復1,140円）となっています。乗船券を販売する新岡山港の切符売り場の営業時間は、基本的に始発便出航の約40分前から最終便出航時刻までオープンしています。自動券売機や窓口ではクレジットカードや主要な電子マネー、QRコード決済にも対応しており、スムーズな発券が可能です。
