小保方氏のプライベートを巡っては、長らく「結婚したのか」「旦那はどんな人物か」という疑問が関心を集めてきました。一連の報道によると、彼女は騒動後に知り合った一般企業に勤務する男性と親密な関係を築き、同棲生活を送っていたことが明らかになっています。
かつて激しいメディアスクラムに晒され、心身ともに極度の疲弊状態にあった小保方氏を献身的に支え続けたのが、このパートナーの存在でした。近隣住民の証言などでは、愛犬を連れて二人で散歩する姿や、近所のスーパーで穏やかに買い物をする様子が伝えられています。
戸籍上の入籍については公式な発表はないものの、事実上の夫婦関係として精神的な安定を取り戻しているとみられます。激動の日々を乗り越え、現在は誰にも邪魔されない平穏な家庭生活を最優先にしている様子が窺えます。