神社本庁の公式指針や各地の神社で一貫して推奨されているのは、神棚の正面が「南向き」または「東向き」（あるいは東南向き）になる配置です。これには太陽の運行サイクルと古代神道の自然崇拝が深く結びついています。
東は太陽が昇る方位であり、活力、新たな始まり、生命力の象徴です。南は一日のうちで最も陽光が降り注ぎ、天地のエネルギーが満ちる繁栄の方角と位置づけられてきました。天照大御神をはじめとする神々を祀るにあたり、明るく暖かな光が降り注ぐ場所を選ぶのは極めて自然な敬意の表れです。
あわせて厳格に守るべき基準が「大人の目線より高い位置」への設置です。一般的な住宅では、床からおよそ180cm〜200cm程度の高さが目安となります。神仏を見下ろす行為は不敬にあたるという心理的バウンダリー（境界線）の配慮に加え、日常の生活動線から一段高い結界を作る意味合いを持ちます。
ネット上では「北向きは祟りがある」といった過激な言説が散見されますが、神棚北向きがNGとされる真相は、神道の呪術的な罰ではなく、物理環境の衛生面に起因します。かつての日本家屋において北側は採光が乏しく、湿気がこもりカビが発生しやすい薄暗い場所でした。清浄を尊ぶ神道において、不衛生でジメジメした暗がりに神札を安置することを避けた生活の知恵が「北向きタブー」の原点です。
