事件発生直後から警視庁捜査本部が最も重大な関心を寄せていたのが、白バイ隊員の息子であった当時19歳の少年Sです。当時の捜査幹部が残した手記や取材証言によると、少年Sは地元・立川周辺の不良グループのリーダー格であり、自動車やバイクの窃盗、無免許運転による暴走行為を繰り返す警察の「要注意人物」でした。
彼が最重要マークされた理由は、単なる素行不良にとどまりません。犯行に使われた偽装白バイ（ヤマハ・スポーツ350R1）の改造手口、雨天の悪路を時速100キロ近い猛スピードで逃走した卓越した運転技術、そして何より「白バイ隊員の家庭事情や警察装備の内情に精通していた」という特異な環境にありました。さらに、事件直前に作成された犯人のモンタージュ写真が少年Sの風貌と酷似していた事実が、捜査本部の確信を強める要因となりました。
しかし、捜査が急展開を迎えた矢先の1968年12月15日、事件は予期せぬ暗転を迎えます。立川市内の自宅自室で、少年Sが青酸カリによる中毒死を遂げているのが発見されたのです。枕元には父親が購入して保管していたとされるシアン化カリウムのアンプルが残されており、警察は遺書がなかったにもかかわらず、死因を「自殺」と即断しました。事件発生からわずか5日後の急死でした。
「取り調べ直前の被疑者急死」という不自然すぎるタイミングは、マスコミ各社や世論に巨大な疑念を抱かせました。現役の警察官を父に持つ少年が、犯行直後に証拠隠滅のように命を落とした事実こそが、今日まで続く警察関係者犯人説およびもみ消し疑惑の発火点となったのです。
