日大明誠高校最大のストロングポイントとも言えるのが、総合大学である日本大学への圧倒的な進学実績です。例年、卒業生の約65％〜70％が日本大学の各学部へ進学を果たしており、付属校ならではの強固なパイプが構築されています。
日大への内部推薦を獲得するための核となるのが、全付属校共通で実施される「日本大学基礎学力到達度テスト」（高校1年4月、高校2年4月、高校3年4月・9月の計4回）です。このテストの総合成績に基づいて全国の付属生が志望学部・学科にエントリーする仕組みとなっており、日頃の定期テスト対策と基礎学力の定着がそのまま大学合格へと直結します。文系・理系を問わず、法学部、経済学部、文理学部、理工学部、生産工学部、生物資源科学部、さらには医学部・歯学部・薬学部といった医療系学部への進学枠も用意されています。
また、特進コースを中心に、国公立大学（山梨大学、都留文科大学など）やGMARCHをはじめとする難関私立大学への一般入試・総合型選抜での合格実績も堅調です。日大への推薦権利を保持したまま国公立大へ挑戦できる制度も整備されており、生徒一人ひとりの将来像に合わせた柔軟な進路選択が可能です。
