小学校選びや住まい探しで最も確認しておきたいのが通学区域（学区）です。園部小学校の学区は、園部町の中心市街地（小桜町、上本町、本町、新町、美園町など）を中心に、広範なエリアをカバーしています。詳しい通学路の指定や境界地域の詳細については、南丹市教育委員会の就学規定や公式案内で随時確認可能です。
卒業生の多くは、隣接するエリアにある南丹市立園部中学校へ進学します。園部小学校と園部中学校の間では、小中一貫教育の視点を取り入れた教員同士の合同研修や乗り入れ授業、児童と生徒の交流活動が積極的に実施されています。小学校から中学校への進学時に生じやすい「中1ギャップ」を緩和し、9年間を見通した切れ目のない指導体制が整えられている点は、保護者にとって大きな安心材料といえます。
