利便性を高める一方で、利用者が誤解しやすい盲点が「駐車場」と「返却ルール」です。
まず駐車場に関して、パピオスあかし地下の有料駐車場を利用した場合、明石市立図書館の利用による駐車料金の割引サービスはありません（※パピオス内の商業店舗等での買い物に応じた割引規定は各店舗に準じます）。車で本館を訪れると駐車コストが発生するため、基本的にはJR・山陽電車の利用が最も経済的です。一方、車移動が中心の方は、敷地周辺のアクセスが容易な西部図書館を活用するのが賢明な選択と言えます。
次に返却の手間を劇的に減らしてくれるのが、市内各所に設置された返却ポスト（ブックポスト）です。わざわざ館内のカウンターへ並ばなくても、通勤通学の途中で投函するだけで返却が完了します。
- パピオスあかし（1階・4階）：駅直結フロアにあり、通勤経路でそのまま投函可能。
- JR大久保駅・魚住駅周辺の連絡拠点：主要駅周辺の公共連絡スペースに設置。
- 各市民センター・サービスコーナー：市内主要地域の行政窓口併設ポスト。
ただし、CDやDVDなどの視聴覚資料（AV資料）や他自治体からの借受本は、破損リスク防止のため返却ポストへの投函が禁止されています。これらは必ず開館時間内に図書館カウンターへ直接持ち込んで返却してください。
