全国的な知名度を誇る名門校ゆえに、インターネット上では時に明徳義塾の不祥事の噂の真相を巡る検索がなされることがあります。この背景には、2005年夏の甲子園開幕前日に部内暴力や喫煙問題が発覚し、出場辞退を余儀なくされた歴史的な出来事が存在します。
当時、社会的に大きな衝撃を与えたこの事態に対し、学校および指導陣は問題を隠蔽することなく事実を公表し、出場辞退という最も重い判断を下しました。そしてこの痛恨の経験を契機として、同校は指導体制の抜本的な刷新、寮生活の透明化、カウンセリング体制の確立など、全国の高校野球界に先駆けた厳格なコンプライアンス管理システムを構築しました。
現在ネット上で散見される根拠のない体罰疑惑や過激な噂の多くは、過去の事象が断片的に誇張されて語り継がれたものに過ぎません。現在の明徳義塾は、指導者と選手の対話を重視し、明確な行動規範のもとで健全に運営される近代的なスポーツ組織として再生を果たしています。