結論から言うと、「米津玄師」の正しい読み方は「よねづ けんし」です。「玄」の字を濁らせて「よねづ げんし」と読んだり、「師」を訓読みして「よねづ けんじ」と誤読されたりするケースが散見されますが、公式な読み仮名は濁点のない「けんし」となります。
初見ではインパクトのある芸名や雅号のように受け取られがちですが、紛れもなく戸籍上の本名です。メジャーデビュー当時、あまりにも完成された響きと字面から「本名なのか?」とネット上で大きな話題を呼びました。過去のインタビューやメディア出演時にも、本人自ら「よく芸名と勘違いされるが、生まれたときからの本名である」旨を明かしています。