広大な園内を散策した後の休憩やランチには、北山門のすぐ隣に位置する薪窯ピッツァと本格イタリアンが人気のレストラン「IN THE GREEN（イン・ザ・グリーン）」が定番です。開放的なテラス席を備えており、植物園の豊かな緑を眺めながら焼きたてのナポリピッツァや旬の野菜を使ったランチコースを堪能できます。
また、園内中央の「植物園会館」周辺には軽食やソフトクリームを販売するテイクアウトスタンドが複数点在しています。気候が良いシーズンには、園外のベーカリーでパンやデリをテイクアウトし、大芝生地のベンチや芝生の上にシートを広げてピクニックランチを楽しむ家族連れやカップルの姿も多く見られます。
北山通り周辺は京都屈指の洗練されたストリートでもあり、洋菓子店やブーランジェリー、落ち着いたカフェが立ち並んでいるため、植物園の見学前後におしゃれなカフェ巡りを組み合わせるのもおすすめです。
