市販されている一般的な妊娠検査薬の多くは、尿中のhCG（ヒト絨毛性ゴナドトロピン）濃度が50IU/L以上に達した段階で陽性反応を示します。生理周期が順調であれば、生理予定日の1週間後には尿中hCGがこの基準値を大幅に超えるため、検査精度は99%以上とされています。それにもかかわらず予定日を2週間過ぎて陰性が出る背景には、主に3つの生理学的要因が存在します。
第1に考えられるのが、排卵日のズレによる妊娠の可能性です。月経周期が28日周期で安定している方であっても、直前の生活環境の変化や精神的ストレスによって排卵が1〜2週間以上後ろ倒しになる事態は珍しくありません。排卵が遅れて性交渉の時期と重なった場合、本人が想定している「生理予定日」の時点ではまだ受精や着床が完了しておらず、検査薬が感知できるレベルまでhCGが分泌されていない状態（いわゆる検査時期のズレ）が生じます。
第2の要因は、ホルモンバランスの乱れによる生理不順です。女性の月経サイクルは、脳の視床下部・下垂体・卵巣という極めて繊細な連動ネットワーク（視床下部-下垂体-卵巣軸）によってコントロールされています。過密なスケジュール、睡眠不足、環境の変化などが加わると、視床下部からの性腺刺激ホルモン放出ホルモン（GnRH）の分泌が乱れ、卵胞の発育が一時的にストップして生理が著しく遅延します。
第3に、卵胞は発育したものの卵子が排出されない無排卵月経の症状が挙げられます。排卵が起こらない場合、子宮内膜を維持・脱落させる黄体ホルモン（プロゲステロン）が十分に分泌されないため、基礎体温は低温期のまま推移し、予定日を2週間以上過ぎても出血が起きない、あるいは不規則な不正出血として現れるケースが確認されています。
