薬王院の真髄に触れるなら、本堂で毎日厳修される「護摩祈祷」への参列が欠かせません。山伏の吹き鳴らす法螺貝の音とともに堂内に響き渡る大太鼓の重低音、そして本尊の前で天高く燃え上がる護摩の炎。参拝者の祈祷札を火にかざして清める儀式は圧巻で、参列者の心を芯から浄化する強烈な体験となります。
【護摩祈祷の執行時間（目安）】
護摩祈祷は毎日複数回執り行われています。通常期は9:00、11:00、12:30、14:00、15:30のスケジュールで厳修されます（季節・法要行事により変動あり）。祈祷希望者は開始時間の30分前までに本堂横の受付で申し込みを済ませる必要があります。
五感を満たすもう一つの名物が、薬王院大本坊でいただける本格的な「精進料理」です。肉や魚を一切使わず、旬の山菜や大豆加工品、高尾山周辺の湧水を用いて丁寧に仕込まれた料理は、滋味深く身体の細胞一つひとつに染み渡る味わいです。
精進料理は完全予約制（または事前確保推奨）となっており、季節ごとの「高尾膳」（3,500円〜）などが用意されています。春の新緑シーズンや秋の紅葉シーズンは数週間前から枠が埋まるため、薬王院の公式電話受付または所定窓口での早期予約が鉄則です。
御朱印巡りの愛好家にとっても、薬王院は見逃せない聖地です。通常の「飯縄大権現」「不動明王」の力強い墨書に加え、季節の行事や花まつり、紅葉まつりなどに合わせた限定御朱印が授与されます。オリジナルの天狗蒔絵御朱印帳も質が高く、参拝の記念として高い人気を誇ります。
