変異株の出現に伴い、多くの読者が直面した疑問が「既存のワクチンや過去の感染による免疫は通用するのか」という点でした。
結論として、ワクチン効果は「感染予防効果」と「重症化予防効果」で大きく結果が分かれました。中和抗体を回避する能力が高いため、ワクチン接種による「感染そのものを防ぐ効果」は経時的に低下することが確認されました。これにより、過去に感染歴がある人や追加接種を完了した人でも感染する「ブレークスルー感染」が散見されました。
その一方で、体内のキラーT細胞などによる細胞性免疫は変異の影響を受けにくく、入院や死亡を防ぐ重症化予防効果は強固に維持されました。さらに、その後に実用化されたオミクロン株対応の改良型ワクチン（2価ワクチンやXBB対応型、以降の更新ワクチン）によって、変異株に対する広範な免疫プロファイルが再構築されることとなりました。
