にんにくの葉の表面に、まるで鉄サビが浮き出たような直径1〜2ミリ程度のやや盛り上がった小斑点（夏胞子堆）が点在している場合、ほぼ間違いなくさび病（学名：Puccinia allii）を発病しています。病勢が進むとこの斑点の表皮が破れ、中から赤褐色からオレンジ色の微細な粉末状の胞子が無数に噴出します。この胞子が風や雨の跳ね返りによって周囲の健全な葉へ次々と付着し、感染爆発を引き起こします。
にんにくの葉が黄色くなる原因には、春先の肥料切れ（窒素不足）や根腐れ、春腐病（細菌感染）、葉枯病など複数の要因が存在します。しかし、「葉の表面に粉を吹いたようなオレンジ色の隆起斑点があるか」を確認すれば、生理障害による黄化とさび病を明確に見分けることができます。
さび病菌の胞子飛散時期は、主に春（4月中旬〜6月上旬）と秋（10月〜11月）の年2回訪れます。病原菌の生育適温は9〜24℃前後であり、特に15〜18℃前後の涼しく雨が多い気候条件が揃うと急激に活性化します。25℃以上の夏日や真冬の低温期には一時的に活動が停滞しますが、葉の組織内に潜伏した菌糸は死滅せず、好適な温湿度になると再び活動を再開します。
発生を助長する主な圃場環境・栽培要因は以下の通りです。
- 過剰な窒素肥料：窒素成分が多すぎると植物体の細胞壁が軟弱化し、菌糸が組織内へ容易に侵入します。
- 密植と風通しの悪さ：株間が狭く葉が重なり合うと、群落内部の湿度が90%以上に保たれ、胞子の発芽を促進します。
- 連作障害と水はけ不良：前作の被害残渣が土中に残っていたり、排水性が悪い粘土質の土壌では胞子の生存率が高まります。
- 春先の急激な草勢低下：冬の寒害や根傷みによってにんにく自体の抵抗力が落ちた隙を突いて感染が広がります。
