アークダストの館内構造は、機能的に2つのフロアへと分かれている。
1階フロアは、受付と休憩スペース、そして清潔に保たれたトイレが配置されたリラックス空間だ。壁と向き合って疲れた身体を休め、他のクライマーと課題の攻略法について情報交換を行うサロンのような役割を果たしている。
一方、階段を上がった2階フロアには、2つの部屋に分かれたメインのクライミングウォールが設置されている。集中して壁に対峙できる静かな空間が確保されており、自分のペースでじっくりと課題に取り組むことが可能だ。
また、都心部のアウトドア系施設としては非常に珍しいことに、専用の駐車場が2台分用意されている。電車アクセスが基本となる巣鴨でありながら、車でマイペースに訪れたいクライマーにとっても非常に使い勝手が良い。