代々木ゼミナール本部校（代ゼミタワー）は、高さ約134メートルを誇るインテリジェントビルです。単なる教室ビルではなく、教育、情報発信、生活空間が垂直に統合された複合教育施設として設計されています。現在の主要なフロア構成は以下の通り機能分担されています。
地下フロアおよび低層階（1階〜7階）には、総合受付、個別相談ブース、大中小の講義室、そして全国の「代ゼミサテライン予備校」へ高品質な授業を届ける最新鋭のサテライン収録スタジオが集約されています。かつての大教室による詰め込み型講義から、高品質な映像収録と双方向型の対面授業を両立する空間へと進化を遂げました。
中層階（8階〜15階）は、静寂が保たれた専用自習室、個別指導ブース、フェロー（学習アドバイザー）コーナー、教員控室が配置され、受験生が日々のインプットとアウトプットを完結できる構造です。16階には開放感あふれる空中庭園（スカイテラス）と学生ラウンジが設けられ、新宿副都心のパノラマを眺めながら適度なリフレッシュが図れるよう配慮されています。
そして高層階（18階〜25階）に位置するのが、後述する直結型専用寮「ベルズ代々木」です。代ゼミタワーの階数フロア案内を確認すると、通塾、個別質問、自習、食事、宿泊に至るすべての動線がタワー内で完結するよう綿密に設計されていることが分かります。
