膵頭十二指腸切除術を受ける患者の最大の関心事は「手術によってどれだけ長く生きられるか（根治できるか）」という予後です。予後は原発疾患の種類や進行ステージによって大きく異なります。
全国がん登録および日本膵臓学会の追跡調査に基づく、疾患別の5年生存率データは以下の通りです。
- 十二指腸乳頭部がん：5年生存率 約50〜70%（比較的早期に黄疸で発見されやすいため良好）
- 遠位胆管がん：5年生存率 約35〜50%
- 膵管内乳頭粘液性腺がん（IPMC）：5年生存率 約40〜60%（良性IPMNの段階で切除した場合はほぼ100%近い根治性）
- 膵頭部がん（浸潤性膵管がん）：
- Stage I（早期）：5年生存率 約40〜50%
- Stage II（局所進行）：5年生存率 約20〜30%
- Stage III（血管浸潤等）：5年生存率 約10〜15%
膵臓がんの予後は他臓器がんに比べ厳しい現実がありますが、近年は「術前化学療法（NAC）」および「術後補助化学療法（S-1単剤療法、GEM+nab-PTX療法、mFOLFIRINOX療法）」を組み合わせた集学的治療の確立により、切除後の5年生存率は着実に向上しています。「手術単独」ではなく、「手術＋抗がん剤治療」を完遂できる体力をいかに維持するかが、長期予後を左右する最大の分岐点です。
