歴史ファンを魅了し、時に大きな誤解を生んでいるのが、寿永4年（1185年）の「壇ノ浦の戦い 沈んだ真相」です。源平合戦の最終局面において、追い詰められた平家一門は、わずか8歳の第81代安徳天皇を抱いた祖母・二位の尼（平時子）が「波の下にも都がございます」と言い残し、三種の神器と共に関門海峡の荒波へ身を投じました。
このとき、八尺瓊勾玉（神璽）と八咫鏡（鏡）の形代は入った箱が海面に浮き上がるなどして源氏方によって回収されましたが、金属の重みを持つ剣だけは海底深くへと沈み、ついに発見されることはありませんでした。この事件を契機に「草薙の剣は失われた」「今あるものは偽物だ」という説が市井に広まることとなったのです。
しかし、当時の公家日記や『吾妻鏡』などの一次記録を精査すると、壇ノ浦で海に沈んだのはあくまで「皇居に置かれていた形代」であり、熱田神宮に鎮座していた本体は戦乱とは無縁の地で無傷のまま守られていました。宮廷は一時的に神器を欠いた状態となり、後鳥羽天皇は「神器なき即位」を余儀なくされましたが、後に伊勢神宮より献上された神剣（順徳天皇の代に定められたとされる宝剣）を新たな形代として宮中に迎え、儀礼の伝統を再建したのです。
