ブックファースト新宿店の魅力を語る上で欠かせないのが、地下2階の奥に静かに佇む「併設カフェブルーリリー（Cafe Blue Lily）」の存在です。新宿駅周辺のカフェといえば、どこも満席で順番待ちの列が絶えないのが日常風景ですが、ここは知る人ぞ知る隠れ家的な落ち着きを保っています。
店内はダークブラウンのウッド調を基調としたシックなインテリアで統一され、柔らかな間接照明が心地よい読書空間を演出しています。席間隔はゆったりと確保されており、周囲の視線を気にせず本と向き合える構造です。本格的なドリップコーヒーや紅茶、季節のスイーツや軽食が用意されており、読書で疲れた頭を癒やすのに申し分ありません。
利用にあたって留意すべき重要なポイントは、「カフェ内への未会計書籍の持ち込み可否」に関する実務ルールです。近年一部の複合型書店で見られる「未購入の本を何冊でも持ち込んで読み放題」というスタイルとは異なり、ブルーリリーでは原則として購入済み書籍の持ち込み、またはカフェ店頭に配架された一部の閲覧用雑誌の講読が基本ルールとなっています。一見すると制約のように思えますが、この規律があるからこそ、店内が立ち読み感覚の利用者で荒れることなく、高い静寂性と品格が保たれているという側面は見逃せません。
ブックファースト新宿店評判と口コミを精査すると、利用者からは以下のような率直な声が寄せられています。
「西新宿の喧騒が嘘のように静かで、仕事のアイデア出しや集中した読書にこれ以上の場所はない」（30代・経営コンサルタント男性）
「地下2階の専門書コーナーの奥にあるため、ふらっと立ち寄る人が少なく、席の回転も落ち着いている。新宿で最も落ち着けるブックカフェ」（40代・編集者女性）
「未購入本を山積みにする客がいないため、店内の雰囲気が常に上品。珈琲の香りに包まれて買ったばかりの新刊を開く瞬間が至福」（20代・大学院生）
なお、車でのアクセスを検討している方にとって重要なのが「コクーンタワー駐車場提携」の条件です。モード学園コクーンタワーには地下駐車場が完備されており、ブックファースト新宿店での当日のお買い上げ金額（一般的には合計3,000円〜5,000円以上等の規定レシート提示）に応じて、1時間から2時間の駐車料金無料サービス券が発行されます。高層ビル街の駐車場料金は高額になりがちですので、まとめ買いの予定がある場合はレジ精算時に必ず駐車券を提示してください。
