下処理と聞くと面倒な職人技に思えるかもしれませんが、使う道具は「骨抜き（または先の細いピンセット）」ひとつだけです。慣れてしまえば1パック（約20〜30杯）を処理するのに2分もかかりません。指先でも代用可能なその手順を具体的に解説します。
1. ホタルイカ目玉取り方（難易度：極小）
頭部と足の間にある左右2つの黒い目玉を処理します。表面に見えている黒い粒をつまむのではなく、骨抜きの先端を目の根元に少し差し込み、奥にある硬い球体（水晶体）ごと外側へ押し出すように引き抜きます。指先で行う場合は、親指と人差し指の爪で挟んで手前に軽くひねると、つるりと綺麗に外れます。
2. ホタルイカくちばし軟骨処理（難易度：小）
続いて、足の輪の中心部にある「くちばし（からすび）」を取り除きます。足を優しくかき分けると中央に黒褐色の硬い粒が見えます。ここをピンセットで挟み、手前にスッと引き抜くだけです。このくちばしを取り忘れると、噛んだ瞬間にジャリッとした砂のような食感の原因になります。
3. 胴体の軟骨引き抜き（難易度：中）
最後に、胴体（ツボ）の背側に入っている透明なプラスチック状の「軟骨」を抜きます。胴体のフチ（足との境目あたり）からピンセットを薄く差し込み、背中の中央を縦に走る透明なスジをつまんで上部（エンペラ側）へ向かって引き抜きます。指で行う場合は、胴体の先端を軽く押しながら引っ張ると途中で折れずに抜けます。
下処理を終えたホタルイカは、薄い塩水（水500mlに対して塩小さじ1程度）で優しく洗い、ザルにあげたあとキッチンペーパーで余分な水分を完璧に吸い取ることが重要です。パック内に溜まっていたドリップ（旨味と臭みの混ざった液体）を洗い流すことで、生臭さが完全に消失し、洗練された甘みだけが際立ちます。
