北里のもう一つの大きな強みが、日本初の東洋医学研究機関として発足した東洋医学総合研究所との深い連携にある。西洋医学による画像診断や病理検査、処置といったアプローチに加え、漢方医学による全身のバランス調整や体質改善の視点を高度に融合。原因の特定が難しい不定愁訴や慢性疼痛、冷え症、アレルギー疾患に対して独自の治療実績を上げている。
東西両医学の専門医がカンファレンスを重ね、科学的エビデンスに基づく漢方処方を行う姿勢は、国内外から高い評価を獲得している。西洋薬の副作用を和らげつつ全体のQOL（生活の質）を向上させる統合医療の試みは、超高齢社会を迎えた日本の医療モデルにおける重要な指標となっている。
