アニメ第1期では、主人公・画眉丸（CV：小林千晃）と処刑執行人・山田浅エ門佐切（CV：花守ゆみり）が不老不死の仙薬を求めて地獄のような島「神仙郷」へ上陸し、異形の化物や島の統治者である「天仙」たちと死闘を繰り広げる序盤から中盤が描かれました。
原作漫画の換算では、第1期は第1巻から第5巻・第59話付近までを緻密に映像化。物語のターニングポイントとなる、幕府からの追加上陸組（山田浅エ門殊現ら）が島へ向かう場面で幕を閉じました。
第2期で描かれる予定のストーリーと見どころは以下の通りです。
1. 追加上陸組の猛威と三つ巴の乱戦：
圧倒的な剣技と過激な正義感を持つ山田浅エ門殊現（CV：鈴木崚汰）率いる先遣隊、そして石隠れ衆の忍たちが島に侵入。画眉丸たち先発組、島の不老不死・天仙、そして追加組による凄惨な三つ巴のサバイバルが激化します。
2. 「タオ（気）」の概念深化と超絶アクション作画：
天仙に対抗するためのエネルギー概念「タオ」を習得していく画眉丸、亜左弔兵衛（CV：木村良平）、桐馬（CV：小野賢章）、杠（CV：高橋李依）らの覚醒バトル。MAPPAの真骨頂であるカメラワークとエフェクト作画が炸裂します。
3. 天仙の正体と神仙郷の真実：
島を支配する天仙たちの哀しき起源と、画眉丸が妻・結（CV：能登麻美子）への愛を貫き通せるのかという人間ドラマの核心へ突入します。
