熊本市動植物園の魅力は、単なる動物展示にとどまりません。最大の特徴は、湧水都市・熊本の象徴である上江津湖の湖畔に直接隣接している地理的ロケーションにあります。湖から吹き抜ける心地よい風を感じながら、水辺の景観と一体化した園内を周遊できる設計は、全国の都市型動物園でも類を見ない開放感を誇ります。
動物ゾーンでは、人気のアフリカゾウやキリン、ライオン、クロクモザルをはじめ、多様な生息環境を再現。近年実施された展示エリアの改修により、動物本来の行動を引き出す「行動展示」や、バリアフリーに配慮した観察スロープが整備され、小さな子ども連れや車椅子ユーザーでも間近に生き物の息づかいを感じられる構造へと進化を遂げました。
一方、植物園ゾーンに足を踏み入れると、大温室を中心に四季折々の花々が咲き誇る静謐な空間が広がります。春と秋に迎えるバラ園の見頃や、自然共生サイト体験イベント（秋のネイチャーゲーム等）の開催など、豊かな生態系を肌で学ぶエデュケーション拠点としての機能も高まっています。
