バナージとともに新たな道を歩むミネバ・ラオ・ザビは、ビスト財団が建造した超巨大移動工廠コロニー「メガラニカ」を隠れ家として地球圏の辺境宙域を移動し続けています。メガラニカは巨大な推進機関と隠蔽システムを備えており、連邦軍の監視網を巧みに逃れながら、ジオン共和国の過激派や連邦の暴走を抑える「影の調停機関」として機能しています。
一方、ユニコーンガンダム2号機に搭乗し、激闘の果てにバナージと共鳴したリディ・マーセナスは、ミネバ派には加わらず、地球連邦軍の軍籍に留まりました。
名門マーセナス家の重責を背負いながらも、父ローナンの罪と連邦の現実を知ったリディは、連邦の内部から組織を正すための戦いを続けています。サイコフレームの危険性を身をもって知る証言者として、彼は軍上層部の強硬派を牽制し、ミネバたちの存在を間接的に庇護する防波堤の役割を果たしているのです。
