フレッシュな原材料で作られているため、551の肉団子の賞味期限は原則として「購入当日中（常温）」、冷蔵庫で保存する場合でも「翌日中まで」と非常に短い。当日中に食べきれない分は、速やかに適切な保存処理を行う必要がある。
数日かけて楽しみたい場合は、自己責任の範囲にはなるものの551の肉団子の冷凍保存方法を活用するファンが多い。冷凍する際の重要ポイントは「乾燥と酸化の防止」だ。
肉団子を甘酢あんごと1食分（3〜4個程度）に小分けし、ラップで空気が入らないようピッチリと包む。それを冷凍用ジッパー付き保存袋に入れ、金属トレイに乗せて急速冷凍させる。この方法であれば、約2週間程度は風味を保ちやすい。解凍する際は、冷蔵庫で半日ほどかけて自然解凍した後、前述のフライパン蒸し焼きで温め直すと、パサつきを最小限に抑えて美味しく復元できる。
